Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps27aP62983 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps27aP62983 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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