Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crabp1P62965 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crabp1P62965 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms