Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vsnl1P62761 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vsnl1P62761 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms