Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg6P61406 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg6P61406 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smg6P61406 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg6P61406 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms