Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl27P61358 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl27P61358 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms