Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl1P61211 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl1P61211 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arl1P61211 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arl1P61211 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms