Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actr1aP61164 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Actr1aP61164 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms