Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fgf1P61148 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fgf1P61148 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms