Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfia3P60469 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfia3P60469 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms