Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Eif3eP60229 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3eP60229 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms