Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps5P59438 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps5P59438 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hps5P59438 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps5P59438 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps5P59438 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hps5P59438 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms