Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nphp4P59240 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nphp4P59240 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nphp4P59240 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms