Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms