Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Bace1P56818 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Bace1P56818 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace1P56818 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace1P56818 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Bace1P56818 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace1P56818 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace1P56818 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms