Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd5P56812 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd5P56812 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms