Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CckbrP56481 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CckbrP56481 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CckbrP56481 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms