Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtskP55097 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtskP55097 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtskP55097 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtskP55097 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtskP55097 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CtskP55097 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CtskP55097 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtskP55097 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtskP55097 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtskP55097 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtskP55097 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtskP55097 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtskP55097 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CtskP55097 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CtskP55097 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtskP55097 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtskP55097 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtskP55097 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms