Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aqp4P55088 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms