Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ephb3P54754 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ephb3P54754 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ephb3P54754 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ephb3P54754 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ephb3P54754 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms