Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad23bP54728 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23bP54728 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms