Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf9P54130 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf9P54130 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf9P54130 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf9P54130 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf9P54130 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf9P54130 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf9P54130 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf9P54130 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf9P54130 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf9P54130 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf9P54130 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf9P54130 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fgf9P54130 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms