Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PitpnbP53811 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PitpnbP53811 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms