Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa6P50704 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms