Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcl5P50228 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcl5P50228 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms