Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psen1P49769 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psen1P49769 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psen1P49769 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psen1P49769 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Psen1P49769 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms