Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hcls1P49710 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hcls1P49710 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms