Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdk5P49615 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk5P49615 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms