Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CenpcP49452 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpcP49452 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpcP49452 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms