Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ccl11P48298 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl11P48298 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms