Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gbx2P48031 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms