Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
InaP46660 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InaP46660 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InaP46660 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InaP46660 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InaP46660 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
InaP46660 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
InaP46660 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InaP46660 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InaP46660 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InaP46660 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
InaP46660 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
InaP46660 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
InaP46660 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
InaP46660 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
InaP46660 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
InaP46660 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
InaP46660 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
InaP46660 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
InaP46660 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
InaP46660 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms