Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt1P46096 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt1P46096 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt1P46096 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt1P46096 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt1P46096 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt1P46096 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt1P46096 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt1P46096 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt1P46096 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt1P46096 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt1P46096 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt1P46096 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syt1P46096 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syt1P46096 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syt1P46096 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syt1P46096 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt1P46096 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syt1P46096 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Syt1P46096 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms