Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf4P43488 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf4P43488 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms