Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlx1P43345 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx1P43345 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms