Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Egr3P43300 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Egr3P43300 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr3P43300 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr3P43300 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Egr3P43300 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms