Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NodalP43021 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NodalP43021 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NodalP43021 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NodalP43021 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NodalP43021 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NodalP43021 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NodalP43021 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NodalP43021 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NodalP43021 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NodalP43021 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NodalP43021 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NodalP43021 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NodalP43021 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NodalP43021 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NodalP43021 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NodalP43021 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NodalP43021 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NodalP43021 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NodalP43021 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NodalP43021 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NodalP43021 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NodalP43021 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NodalP43021 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NodalP43021 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NodalP43021 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NodalP43021 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NodalP43021 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NodalP43021 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NodalP43021 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NodalP43021 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NodalP43021 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NodalP43021 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NodalP43021 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NodalP43021 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NodalP43021 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NodalP43021 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NodalP43021 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NodalP43021 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NodalP43021 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NodalP43021 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NodalP43021 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NodalP43021 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NodalP43021 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NodalP43021 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NodalP43021 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms