Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nkx1-2P42580 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nkx1-2P42580 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nkx1-2P42580 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms