Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pik3caP42337 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pik3caP42337 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms