Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Elk1P41969 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk1P41969 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elk1P41969 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms