Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CskP41241 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CskP41241 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CskP41241 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CskP41241 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CskP41241 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CskP41241 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CskP41241 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CskP41241 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CskP41241 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CskP41241 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CskP41241 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CskP41241 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CskP41241 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CskP41241 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CskP41241 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CskP41241 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CskP41241 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CskP41241 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CskP41241 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CskP41241 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CskP41241 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CskP41241 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CskP41241 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CskP41241 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CskP41241 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CskP41241 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CskP41241 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CskP41241 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CskP41241 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CskP41241 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CskP41241 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CskP41241 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CskP41241 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CskP41241 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CskP41241 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CskP41241 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CskP41241 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CskP41241 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CskP41241 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CskP41241 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms