Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rpl28P41105 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms