Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tjp1P39447 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tjp1P39447 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms