Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sar1aP36536 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sar1aP36536 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms