Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flt1P35969 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flt1P35969 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flt1P35969 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Flt1P35969 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flt1P35969 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Flt1P35969 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Flt1P35969 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Flt1P35969 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Flt1P35969 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Flt1P35969 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt1P35969 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Flt1P35969 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt1P35969 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt1P35969 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt1P35969 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt1P35969 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt1P35969 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Flt1P35969 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt1P35969 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt1P35969 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Flt1P35969 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Flt1P35969 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt1P35969 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt1P35969 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Flt1P35969 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Flt1P35969 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt1P35969 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Flt1P35969 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt1P35969 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt1P35969 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt1P35969 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Flt1P35969 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt1P35969 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt1P35969 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt1P35969 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flt1P35969 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt1P35969 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Flt1P35969 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt1P35969 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt1P35969 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt1P35969 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt1P35969 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt1P35969 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt1P35969 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt1P35969 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Flt1P35969 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Flt1P35969 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Flt1P35969 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Flt1P35969 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Flt1P35969 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt1P35969 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Flt1P35969 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt1P35969 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt1P35969 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt1P35969 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt1P35969 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt1P35969 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flt1P35969 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Flt1P35969 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms