Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprkP35822 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprkP35822 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprkP35822 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprkP35822 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprkP35822 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprkP35822 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprkP35822 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PtprkP35822 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms