Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ddit3P35639 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddit3P35639 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddit3P35639 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddit3P35639 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddit3P35639 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddit3P35639 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddit3P35639 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ddit3P35639 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddit3P35639 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddit3P35639 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddit3P35639 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddit3P35639 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddit3P35639 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddit3P35639 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddit3P35639 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddit3P35639 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ddit3P35639 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddit3P35639 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddit3P35639 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddit3P35639 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddit3P35639 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddit3P35639 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddit3P35639 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddit3P35639 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ddit3P35639 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddit3P35639 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddit3P35639 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddit3P35639 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddit3P35639 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddit3P35639 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ddit3P35639 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddit3P35639 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ddit3P35639 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ddit3P35639 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddit3P35639 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddit3P35639 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddit3P35639 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms