Protein–RNA interactions for Protein: P35492

Hal, Histidine ammonia-lyase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HalP35492 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HalP35492 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HalP35492 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HalP35492 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HalP35492 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HalP35492 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HalP35492 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HalP35492 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HalP35492 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HalP35492 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HalP35492 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HalP35492 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HalP35492 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HalP35492 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HalP35492 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HalP35492 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HalP35492 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HalP35492 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HalP35492 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HalP35492 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HalP35492 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HalP35492 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HalP35492 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HalP35492 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HalP35492 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HalP35492 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HalP35492 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HalP35492 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HalP35492 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HalP35492 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HalP35492 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HalP35492 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms