Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Grin1P35438 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Grin1P35438 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms