Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab23P35288 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab23P35288 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms