Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc11P31313 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc11P31313 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms